甲型流感以其病人为主要传染源，主要在人类中传播。感染途径主要通过飞沫或气溶胶经呼吸道传播，也可通过口腔、鼻腔、眼睛等处黏膜直接或间接接触传播，接触患者的呼吸道分泌物、体液或被污染的物品亦可能造成传播。
甲型流感的早期症状与普通流感相似，包括发热、咳嗽、喉痛、头痛、身体疼痛、发冷和疲劳等。有些患者还会出现腹泻或呕吐、肌肉痛或疲倦、眼睛发红等症状。部分患者病情可迅速进展，来势凶猛、突然高热、体温超过39℃，继发严重肺炎、急性呼吸窘迫综合征、肺出血、胸腔积液、全血细胞减少、肾功能衰竭、败血症、休克及Reye综合征、呼吸衰竭及多器官损伤，甚至导致死亡。患者原有的基础疾病亦可加重。
在已发现的感染病例中，13岁以下儿童所占比例较高，病情较重，属于易感人群。四类最易感染流感的人群分别是老年人，患有肝脏、肾脏、心脏等慢性病的人群，经常接触流感人群的医护人员和儿童。甲型H1N1流感的死亡率为6.77%，比一般流感要高。其高致死率的主要原因有两个：一是病毒来势凶猛;二是民众起初对新疾病不重视，以为是普通感冒，很多人自己随便吃些药，错过了发病初72小时的最佳救治期。
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